برخی از دستگاه های تقطیر تنها قادرند درصد کمی از ترکیبات معدنی رایج موجود در آب نظیر سدیم را حذف کنند. علاوه بر این، روش تقطیر عملکرد خوبی در مقابل تصفیه مواد شیمیایی فرار که نقطه جوش پایینی دارند، از خود نشان نمی دهد. به عنوان مثال کلرو آمین ها که امروزه برای ضدعفونی کردن آب به جای کلر استفاده می شوند، با استفاده از روش تقطیر به خوبی از آب حذف نمی گردند.
در حالی که تصفیه آب به روش اسمز معکوس به همراه فیلترهای کربنی فعال نظیر فیلتر کربن پودری و فیلتر کربن بلاک ، عملکرد خوبی در برابر حذف کلروآمین ها از آب دارد. هر چند که می توان در روش تقطیر قبل از ورود آب به محفظه جوش توسط فیلترهای کربنی ترکیبات شیمیایی فرار کلریدی را از آب جدا کرد.
به طور کل می توان گفت خلوص آب تصفیه شده به روش تقطیر همانند روش اسمز معکوس می باشد.